67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0858 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  100 
 
 
94 aa  190  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  40.28 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  38.67 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  43.42 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  38.67 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  32 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  33.9 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  33.9 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  33.82 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  36.54 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  33.85 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  36.67 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  36.11 
 
 
223 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  40.35 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  40.35 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  37.1 
 
 
325 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  35.59 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.84 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.59 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  35.59 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  35.59 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  30 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  40.43 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.58 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  28.38 
 
 
76 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  33.9 
 
 
77 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
324 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  28.99 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  30 
 
 
199 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  33.9 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  33.9 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  33.9 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  28.57 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  33.9 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  33.9 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  27.71 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0043  hypothetical protein  39.06 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  30.65 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  26.09 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  26.09 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  27.54 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  30.88 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  29.41 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  31.58 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  38.1 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  27.54 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  28.99 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  26.09 
 
 
75 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  26.09 
 
 
75 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>