128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1817 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  98.34 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  49.3 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  49.3 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  50.72 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  52  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  39.13 
 
 		 82 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  36.11 
 
 		 85 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  42.59 
 
 		 81 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  54.29 
 
 		 325 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  36.23 
 
 		 75 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  37.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  39.71 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  38.24 
 
 		 76 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  32.39 
 
 		 75 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  37.66 
 
 		 94 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  36.21 
 
 		 72 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  44.64 
 
 		 100 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  37.1 
 
 		 83 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  36.76 
 
 		 70 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  38.24 
 
 		 93 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  38.24 
 
 		 70 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 76 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  37.66 
 
 		 88 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.29 
 
 		 76 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  35.29 
 
 		 70 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  40.3 
 
 		 78 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  36.76 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  39.13 
 
 		 82 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  39.13 
 
 		 82 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  33.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  37.04 
 
 		 82 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  36.23 
 
 		 89 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.86 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  45.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  34.29 
 
 		 75 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  34.33 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  32.86 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  35.09 
 
 		 76 aa  43.9  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.93 
 
 		 76 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2122  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1252 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  32.76 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 		 108 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  27.94 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  31.43 
 
 		 78 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  32.76 
 
 		 82 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  32.39 
 
 		 80 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  32.39 
 
 		 80 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  32.86 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  32.86 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  38.57 
 
 		 91 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  30.99 
 
 		 80 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  29.85 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  45.45 
 
 		 80 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  35.19 
 
 		 81 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  32.86 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  36.67 
 
 		 87 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  35.29 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  48.65 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  46.34 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  37.29 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.82 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  30.77 
 
 		 88 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  30.38 
 
 		 81 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  54.05 
 
 		 101 aa  42.4  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>