177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1739 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  74.67 
 
 
73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  44.93 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  44.93 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  35.62 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  38.67 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  41.43 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  32.39 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  42.62 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  32.35 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  37.5 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  30.56 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.08 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  32 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  35.48 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  32.43 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  37.14 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  30.99 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  33.33 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  40.32 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  32.84 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  28.38 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  36 
 
 
75 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 
81 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  28.57 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  30.67 
 
 
76 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  31.08 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  31.43 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  30.67 
 
 
76 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  30.67 
 
 
76 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  30.67 
 
 
76 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  30.99 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  30.67 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  30 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  24.66 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  35 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  28.99 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  30.99 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  32.35 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  38.71 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  30.99 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  29.58 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  25.35 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.93 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  28.38 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  29.73 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.75 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  30.99 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  34.25 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  30.36 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  26.76 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  28.17 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  28.17 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  33.9 
 
 
213 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  25.35 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  35.09 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  30 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  35 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  30.88 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  30 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  32 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  25.35 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  29.58 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  28.17 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  29.69 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  32 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  32 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  34.55 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  26.87 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  32 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  36.21 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  28.36 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  38.64 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  30 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  33.82 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>