23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3934 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  100 
 
 		 82 aa  163  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3921  SirA family protein  49.33 
 
 		 77 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  42.62 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  42.62 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  44.26 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  42.62 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  40.98 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  41.79 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  38.57 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  39.13 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  30.51 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  32.86 
 
 		 84 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  32.84 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.88 
 
 		 813 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  29.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  29.41 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  34.92 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  27.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  27.14 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  35.14 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>