149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 		 73 aa  152  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  32.88 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  34.25 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  34.25 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.43 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.43 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  35.82 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.78 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  29.85 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  34.48 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  32.84 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  31.34 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  31.34 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  32.84 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  32.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  32.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  30.77 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  30.77 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  28.36 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  26.87 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  32.86 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  28.57 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.82 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  29.23 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  26.87 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  28.36 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  29.41 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  34.55 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  28.79 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  31.34 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  31.34 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  27.94 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  25.37 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  31.34 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  26.47 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  28.77 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  34.38 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  35.29 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  25.71 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  25.71 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  28.36 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  29.41 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  31.34 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  29.85 
 
 		 81 aa  43.9  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  25.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  26.03 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  29.85 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  29.41 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  26.87 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  26.87 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 		 831 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  26.87 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  23.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  24.64 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  30.36 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  28.12 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  29.85 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  23.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  34.33 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  29.85 
 
 		 81 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  28.77 
 
 		 75 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  30 
 
 		 91 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  25.37 
 
 		 81 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  28.24 
 
 		 97 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  28.12 
 
 		 83 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>