53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3765 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  51.28 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  44.87 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  48.33 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  43.42 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  46.58 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  50.91 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  44.78 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  40.91 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  43.64 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  46.67 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  40.68 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  40.32 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  36.76 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  36.76 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  39.44 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  44.07 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  43.33 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  43.33 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  40 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  39.62 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  35.59 
 
 		 796 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  30 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  37.84 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  35.21 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  37.14 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  34.78 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  37.84 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  41.07 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  38.18 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.84 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  31.43 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  31.43 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  27.94 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  32.39 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  36.62 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.71 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  27.94 
 
 		 75 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  27.94 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  40.38 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  27.94 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  28.17 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  27.94 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  26.44 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>