271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1758 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  100 
 
 
79 aa  158  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  100 
 
 
79 aa  158  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  75.36 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  47.14 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  47.89 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  44.12 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  38.16 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  44.93 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  36.36 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  48.57 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  42.86 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  43.55 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  47.06 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  34.25 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  44.93 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.8 
 
 
76 aa  60.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  42.03 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  38.96 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  47.54 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  47.54 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  39.71 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  47.54 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  47.54 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.39 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  45 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  49.18 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  39.06 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  36.92 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  45.9 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  37.14 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  34.72 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  36.23 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  34.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  38.89 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  46.43 
 
 
325 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  42.11 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  38.89 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  42.11 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  42.65 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  44.26 
 
 
77 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  42.65 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  33.9 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.38 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.38 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  38.71 
 
 
75 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  40.62 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  38.98 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  43.86 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  41.18 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.06 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  39.06 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  39.06 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  39.68 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  39.06 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  39.47 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  39.66 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.67 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  37.1 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  39.06 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.67 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  42.25 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  41.79 
 
 
72 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  39.34 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  37.88 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  38.81 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  39.71 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  40.68 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.59 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  35.82 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>