69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0828 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  168  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  61.64 
 
 
79 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  58.9 
 
 
89 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  58.9 
 
 
89 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  58.9 
 
 
89 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  58.33 
 
 
77 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  57.53 
 
 
77 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  56.16 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  50.68 
 
 
78 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  53.52 
 
 
75 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  53.52 
 
 
75 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  52.11 
 
 
75 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  84  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  42.42 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  39.44 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  39.44 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  35.8 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  40 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  35.62 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  40.62 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  40.62 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  32.91 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  30.99 
 
 
94 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  41.46 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  30.99 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  34.48 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  30.88 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  31.94 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  33.33 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  31.88 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  28.99 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  29.63 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  25.93 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.2 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  26.47 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  30.99 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  30.67 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  26.47 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  40 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  30.43 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  30.56 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  29.41 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  29.41 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  34.55 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  26.92 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  42.11 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  30.43 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.19 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  31.58 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  32.84 
 
 
77 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>