34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1543 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  156  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  52.5 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  50.72 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  48.89 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  45.65 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  47.83 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  45.65 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  45.65 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  45.65 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  41.46 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  30.56 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  30.56 
 
 
82 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>