160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0365 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  81.33 
 
 		 75 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  81.33 
 
 		 75 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  81.33 
 
 		 75 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  68.49 
 
 		 78 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  64.29 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  59.46 
 
 		 77 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  56.76 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  56.76 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  56.76 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  58.57 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  45.71 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  47.14 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  47.14 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  45.83 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  43.55 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  43.55 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  39.13 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  38.71 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.11 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.84 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.24 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.14 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.49 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  37.14 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  37.5 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  37.5 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 184 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.07 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.43 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  34.72 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  32.43 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  31.08 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  32.43 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  35.29 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  35.14 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  33.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  36.23 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.24 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  35.21 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  31.08 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  32.43 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.87 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  32.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  29.73 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  29.17 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  36.23 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  36.76 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  34.72 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  36.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  32.35 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.77 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>