28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1262 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  100 
 
 		 116 aa  236  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  38.03 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  35.06 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  36.62 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  36.67 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  30.88 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  34.78 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  31.34 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  32.35 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.51 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  34.09 
 
 		 92 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  32.35 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  27.4 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  38.64 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  27.4 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  34.78 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.91 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  30.43 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>