228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2083 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  48.61 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  47.14 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  47.14 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  43.06 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2416  SirA family protein  48.53 
 
 
80 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0668524  normal  0.999946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  40.28 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  49.21 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  37.68 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  40.3 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  40.3 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  35.9 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.84 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  31.94 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.84 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  29.85 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
817 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  32.86 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  37.31 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  36 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  34.67 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  38.57 
 
 
77 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  32.39 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  33.33 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  28.36 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  28.36 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  34.67 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  34.67 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
80 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  42.86 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  35.09 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  33.8 
 
 
92 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.56 
 
 
189 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  32.91 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  26.39 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  31.34 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.92 
 
 
834 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  36.51 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.33 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  40.98 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  32.86 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  32.35 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  34.33 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  26.87 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  34.33 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  32 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  26.47 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  31.08 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  31.34 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  30 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.49 
 
 
938 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 
831 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 
813 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  29.41 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  32.79 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.34 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  29.41 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  28.57 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  28.36 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  36.21 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  26.47 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  30 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  36.36 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  26.47 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  28.79 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  29.85 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  29.41 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  26.47 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  28.36 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  31.15 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  34.29 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  33.82 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
356 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  32.35 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  28.57 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  28.36 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.31 
 
 
837 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  27.94 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  30.43 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  30 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  29.73 
 
 
820 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  27.78 
 
 
194 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  30.88 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>