129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1404 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  100 
 
 		 85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  49.28 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  52.05 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  46.05 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  41.43 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  41.43 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  46.67 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  40 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  43.86 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  41.18 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 354 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 354 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  38.03 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2416  SirA family protein  46.67 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0668524  normal  0.999946 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  46.38 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  38.03 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  42.11 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 354 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 354 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 354 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.44 
 
 		 813 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.42 
 
 		 817 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.94 
 
 		 938 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.18 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  40.91 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  35.19 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.18 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 		 864 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.07 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.58 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  34.43 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 		 834 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 		 837 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  38.78 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  34.85 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  41.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  38.24 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  41.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  38.16 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.92 
 
 		 831 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0208  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  37.14 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  44.44 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  31.03 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.41 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  37.29 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  39.62 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  31.58 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  36.76 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  38.6 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.25 
 
 		 820 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  35.14 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  38.6 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  31.43 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0228  SirA-like  35.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000086936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  27.78 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  37.29 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  37.1 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  37.1 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  26.39 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  36.92 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  33.85 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  37.74 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  31.58 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  31.03 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  34.78 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 		 817 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  31.94 
 
 		 560 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  33.82 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  37.93 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>