130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2416 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2416  SirA family protein  100 
 
 		 80 aa  157  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0668524  normal  0.999946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  48.53 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  46.38 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  39.47 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  46.15 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  46.15 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  47.37 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  46.67 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  37.68 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  40 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.88 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  35.38 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  32.05 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  32.05 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  32.05 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  29.49 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  26.92 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  35.38 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  31.34 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  25.76 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  25.76 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  26.92 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  26.92 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  29.49 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  37.29 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  32 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  33.87 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 831 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  34.29 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  32.35 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  25.64 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  25.64 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  27.14 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  26.92 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  28.21 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.14 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  25.37 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  24.64 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  25.64 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  27.94 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  29.49 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.94 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  29.85 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  32.35 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  31.51 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  25.35 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  30.14 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  30 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  30.14 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  31.08 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  29.17 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  26.87 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  25.64 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  32.39 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  25.37 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  26.87 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  23.19 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  24.29 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  24.36 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  31.17 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  25.37 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  24.36 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 		 817 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  30.99 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  25.37 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  25.37 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  25.71 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  21.43 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  26.76 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  30.88 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  31.34 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  27.03 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  31.15 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  25.71 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  27.14 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  25.35 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  24.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  24.29 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>