297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2575 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  100 
 
 		 85 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  53.16 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  53.16 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  52.05 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  50 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  51.9 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  51.39 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  49.32 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  47.95 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  46.58 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  42.47 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  48 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  42.47 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  42.47 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  47.06 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  48.61 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  42.65 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  42.25 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  42.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  42.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  46.38 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  38.57 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.65 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  45.59 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  38.67 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  44.12 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  44.12 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  44.44 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.18 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  44.12 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  52.83 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  40.85 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  36.84 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  45.59 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  44.87 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  43.06 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  52.83 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.51 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  40.85 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.73 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.67 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.03 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  41.1 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  38.03 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.99 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  36 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  49.06 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  33.75 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  32.47 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  38.24 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  35 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  33.8 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  38.03 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  35.62 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  31.25 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.99 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  32.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.39 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  31.25 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  56.82 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  30.86 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0208  hypothetical protein  54.17 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  34.25 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  37.14 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  31.51 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>