250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0357 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0228  SirA-like  44.2 
 
 
161 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000086936  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0208  hypothetical protein  55.56 
 
 
155 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  47.54 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  47.54 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  61.36 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  61.36 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  47.54 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  47.54 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  47.54 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  61.36 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  58.33 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  61.36 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  58.33 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  55.56 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  56.82 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  48.08 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  44.26 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.23 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  48.08 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.15 
 
 
189 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  36.76 
 
 
213 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  40 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.23 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  50 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  29.03 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  52.27 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  52.08 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  48.08 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  52.27 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  48.08 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  54.55 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  50 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  45.83 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  39.34 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  45.83 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  50 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  54.55 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  46.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  54.17 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  42.31 
 
 
76 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  46.15 
 
 
75 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  37.5 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  44.23 
 
 
186 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  42.86 
 
 
76 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40.38 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  45 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  34.67 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  37.74 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  41.27 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.29 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  42.62 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  47.92 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  40.38 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  32.93 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  33.93 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  33.82 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.87 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.87 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  47.92 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  38 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  42.31 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  42.31 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.85 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  47.92 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  42.31 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  37.29 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  42.86 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  39.58 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  37.5 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  31.03 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.38 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  40.38 
 
 
186 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  42.22 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>