43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4317 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4317  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4295  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4309  hypothetical protein  83.33 
 
 
105 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.594974 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  35.82 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  40.74 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  35.71 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  30.14 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.87 
 
 
813 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
831 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.59 
 
 
817 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.34 
 
 
864 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  37.29 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  35.19 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  29.41 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  29.41 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  28.99 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.29 
 
 
817 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  30.91 
 
 
86 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  30.88 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  34.55 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  32.73 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  32.73 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  32.73 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  32.73 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  26.47 
 
 
354 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 
354 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 
354 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  36.54 
 
 
560 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  26.23 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  26.32 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  30.65 
 
 
76 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>