40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0063 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  52.24 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  41.79 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  49.23 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  36.36 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  31.88 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  49.02 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  43.08 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  39.71 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  38.24 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  31.88 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  31.88 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  43.1 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  35.82 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  31.88 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  40.3 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  42.37 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  34.78 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  39.71 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  45.1 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  33.33 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  34.78 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  40.98 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.35 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  37.88 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  33.82 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  38.03 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  33.82 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  35.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  31.03 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  36.67 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  29.85 
 
 		 193 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  34.29 
 
 		 204 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.88 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  35.19 
 
 		 193 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  28.57 
 
 		 83 aa  40  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>