43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2466 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  43.08 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  40.91 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  40.85 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  43.75 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  45 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  40.91 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  38.81 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  38.71 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  41.54 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  45.31 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  49.15 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  39.06 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  35.94 
 
 		 195 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  41.27 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  35.29 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  37.88 
 
 		 199 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  40.3 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  36.36 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  33.85 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  38.81 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.65 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  38.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  42.86 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  39.66 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  34.29 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  41.79 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  52.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  44.68 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  37.25 
 
 		 211 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  43.48 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  33.33 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  36.51 
 
 		 200 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  36.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  33.9 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.67 
 
 		 199 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  30.14 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>