69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2082 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  100 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  54.17 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  52.24 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  50 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  36.62 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  53.12 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  40.3 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  44.29 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  40.91 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  44.29 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  42.59 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  44.12 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  40 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  42.59 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  50 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  36.76 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  40 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  28.99 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  43.08 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  39.29 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.79 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  44.64 
 
 		 195 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  44.64 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  34.92 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  30.16 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.34 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  36.07 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  31.34 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  37.5 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  36.54 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  25.68 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  39.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  37.31 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.22 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  26.87 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  33.93 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  34.38 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.18 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  30.88 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  30.77 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  33.82 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  30.77 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  25.37 
 
 		 190 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  30.77 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.77 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  25.37 
 
 		 190 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  30.77 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  32.35 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.11 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  39.22 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  26.98 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  29.41 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  34.62 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  29.85 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  32.35 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  40.82 
 
 		 200 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  29.85 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  32.35 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  36 
 
 		 223 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>