58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3246 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  100 
 
 		 73 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  54.17 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  47.83 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  50 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  47.06 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  47.95 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  49.28 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  46.15 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  40.28 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.91 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  44.62 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  37.84 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  40.3 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  45.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  39.39 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  42.03 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  36.23 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  39.39 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  36.92 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  40.3 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  39.58 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  34.25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  38.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.57 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  32 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  34.48 
 
 		 211 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  28.17 
 
 		 83 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  33.82 
 
 		 199 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  37.5 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  32.86 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  36.36 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.21 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  26.47 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  31.94 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  31.94 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  37.31 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.51 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  31.82 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  40.38 
 
 		 70 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>