37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00550 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 
68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  53.73 
 
 
68 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  48.53 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  41.79 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  44.26 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  46.15 
 
 
73 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  33.82 
 
 
199 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  38.24 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  36.76 
 
 
195 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.82 
 
 
196 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  35.29 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  33.85 
 
 
199 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  33.82 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  39.13 
 
 
196 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  42.65 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  48.98 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  35.82 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.24 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  36.76 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  35.29 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  35.82 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  35.29 
 
 
195 aa  43.5  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  39.29 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  33.33 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  37.1 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  33.33 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  37.31 
 
 
213 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  30.77 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  26.87 
 
 
190 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  25.29 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  30.3 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  31.75 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  30.88 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  38.46 
 
 
200 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  36.92 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40.3 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>