24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.73 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  41.79 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  35.82 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  43.94 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  48.21 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  35.94 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  34.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  32.35 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.82 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  35.94 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  35.38 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  39.62 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  36.36 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  30.77 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  32.84 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  32.84 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  39.58 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  32.35 
 
 		 196 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  31.25 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  33.87 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  35.48 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  31.82 
 
 		 199 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>