102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3940 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  100 
 
 		 74 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  85.92 
 
 		 74 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  85.92 
 
 		 74 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  81.69 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  81.69 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  50.7 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  52.17 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  62 
 
 		 796 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  48.53 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  47.06 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  40.58 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  43.06 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  43.75 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  41.67 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  40.85 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  41.67 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  43.75 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  39.71 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  40.85 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  39.71 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  51.92 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  32.88 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  39.71 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  40.32 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  42.59 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  38.98 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  42.25 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  33.33 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  37.5 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  42.59 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  39.13 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  36.23 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  41.1 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  40.54 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  34.72 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.31 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  42.59 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.82 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  42.59 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  36.11 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  36.11 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  36.11 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30.99 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  36.11 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  42.31 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.8 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.33 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  40.74 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  30.43 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  33.33 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.99 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.9 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  43.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  35.21 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  35.62 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  27.94 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.73 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  36.49 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  44.83 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  33.9 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  34.55 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  44.07 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  47.83 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  31.94 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  33.8 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  37.25 
 
 		 200 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  32.84 
 
 		 189 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  29.69 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  33.8 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  31.15 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  30.88 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.73 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  30.77 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  44.23 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  32.2 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  32.2 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  34.78 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  33.82 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  29.73 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  32.39 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  31.15 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 		 186 aa  40  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 		 186 aa  40  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.91 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  29.73 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  27.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>