29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1345 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  156  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  96.2 
 
 
79 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  38.96 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  49.3 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  44.78 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  39.68 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  39.73 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  39.13 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  37.88 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  37.88 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  42.25 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  39.13 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  37.88 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  41.07 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  36.23 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  28.38 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  40.74 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  36.07 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  41.07 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  26.67 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  36.07 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  36.54 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  36.54 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  33.9 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  40  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>