36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3413 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  64.29 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  45.71 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  42.25 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  43.06 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  38.36 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  41.43 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  41.33 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  39.47 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  54.72 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  54.72 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  41.89 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  49.02 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  43.14 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  53.57 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  49.02 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  46.3 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  46.3 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  41.89 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  42.25 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  50.98 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  41.43 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  40.85 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  52.38 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  42.31 
 
 		 796 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  34.78 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  38.36 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  38.89 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  43.86 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  39.29 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  39.22 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  38 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>