141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1972 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  100 
 
 		 71 aa  143  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  53.52 
 
 		 73 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  57.75 
 
 		 76 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  50.7 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  50.7 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  53.52 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  53.52 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  54.93 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  53.52 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  53.52 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  50.7 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  53.52 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  53.52 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  48.57 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  40.32 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.8 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.99 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  27.54 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  38.33 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  28.99 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.39 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  37.29 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  39.58 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  34.48 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  32.65 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  34.48 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  26.76 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  34.48 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  35.59 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  39.58 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  36.21 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  36.23 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  38.78 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  30 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  32.76 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  34.48 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  36.21 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.61 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  37.29 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  35.21 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0606  SirA-like  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  29.31 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  36.73 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  35.21 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  42.31 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  29.58 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  38.78 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  34.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  38.78 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  38.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  38.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  32.65 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  40.82 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  40 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  33.8 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  33.87 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  31.37 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  33.9 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  31.37 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  27.27 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  38.78 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  28.99 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  36 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  30 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  38.78 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 		 813 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.35 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  31.37 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  38.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  31.37 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  31.88 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  37.29 
 
 		 76 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>