59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1756 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  57.53 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  53.42 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  52.05 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  47.95 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  53.52 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  43.66 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  45.07 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  41.1 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  38.57 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  35.71 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  30.56 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  31.43 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  29.58 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  32.86 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  27.94 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  28.57 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  27.54 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  31.43 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  27.54 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  33.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  31.43 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  28.57 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.78 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  27.14 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  36 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 813 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  29.85 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>