87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1842 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  59.15 
 
 		 73 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  60 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  53.52 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  50.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  50.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  50.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  50.68 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  50.68 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  52.05 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  47.95 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  41.1 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  35.59 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  29.41 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  33.82 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  32.35 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  35.59 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  32.88 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  28.17 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  32.86 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  28.99 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  36.07 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  27.54 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.87 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  29.41 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  27.94 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.26 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  39.34 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  36.07 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  40 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.85 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  26.67 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  25.42 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  41.18 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  31.43 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  40 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  40 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  30.14 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  40 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  27.94 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  37.7 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.64 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  27.54 
 
 		 81 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  30.3 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.65 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  38.6 
 
 		 75 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  33.93 
 
 		 81 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  38.24 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.99 
 
 		 813 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  31.25 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40.35 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  32.08 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  27.54 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  36.73 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  31.34 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  34.43 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  37.5 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  29.41 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  32.79 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>