114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4106 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  67.09 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  60.76 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  57.5 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  57.14 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  52.11 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  50.7 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  50.7 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  50.7 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  51.43 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  44.44 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  38.96 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  38.46 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  40.28 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  34.25 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  45.71 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  35.71 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  41.18 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  50.98 
 
 		 796 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  41.18 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  39.39 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  32.47 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  35.14 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.5 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  41.67 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  34.72 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  42.37 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  36.67 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  36.67 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  35.59 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.51 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.56 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  35 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  36.67 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  38.18 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.35 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  25 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  34.67 
 
 		 272 aa  48.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  25 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  29.73 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  35.19 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  37.29 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  39.66 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  25.64 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  34.92 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  32.05 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  30.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  32.88 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.35 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  29.85 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  25.71 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  33.82 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.38 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  30.56 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  31.43 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.77 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  27.14 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.88 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  31.75 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  27.78 
 
 		 75 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  31.15 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  26.92 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  24.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  24.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  24.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  24.66 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  30.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>