97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2170 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  100 
 
 		 73 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  73.61 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  59.15 
 
 		 73 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  59.72 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  59.72 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  59.72 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  59.72 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  58.33 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  55.56 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  53.52 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  55.56 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  55.56 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  52.78 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  52.05 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  46.27 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  43.66 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  37.1 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  36.23 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  32.39 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  31.88 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  32.35 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  36.07 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.43 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  44.44 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  39.66 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  32.35 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  32.88 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0927  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.29532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  30.88 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  31.75 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  30.88 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  30.88 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  31.15 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  27.54 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  27.94 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  32.86 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  30.88 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  27.94 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  31.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  29.41 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  35.62 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  26.47 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  27.94 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  28.99 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  29.41 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  34 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  30 
 
 		 796 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  37.04 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  29.41 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3188  hypothetical protein  38.71 
 
 		 79 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32.84 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  27.94 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  25 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  29.41 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  27.94 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  27.94 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  40.82 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  30 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  30.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  42.31 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  35.94 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  26.47 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  26.47 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  38.89 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  36.84 
 
 		 101 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>