56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1752 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  100 
 
 
89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  67.12 
 
 
84 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  70.83 
 
 
85 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  69.74 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  67.11 
 
 
84 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  73.91 
 
 
79 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  73.91 
 
 
79 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  57.14 
 
 
83 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  45.83 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  53.23 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  47.06 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  48.57 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  48.57 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  45.83 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  38.96 
 
 
796 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  44 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  52.63 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  56.6 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  39.39 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  35.8 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  33.75 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  35.8 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  41.33 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  35 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  35.62 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  42.11 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  40.35 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  33.78 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  41.43 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  41.43 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  42.42 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  41.82 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  43.86 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  43.86 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  42.86 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  39.62 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  41.07 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  40.98 
 
 
77 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  40.98 
 
 
77 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  40.98 
 
 
77 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  32.43 
 
 
82 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  38.18 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  32.43 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  38.98 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  51.35 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  37.5 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  36.67 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  30 
 
 
85 aa  42  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  38.18 
 
 
80 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  29.51 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
184 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>