56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2099 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  100 
 
 
80 aa  160  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  51.28 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  51.43 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  44 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  41.33 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  44.26 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  41.89 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  39.74 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  34.78 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  33.8 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  37.5 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  37.5 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  36.49 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  42.62 
 
 
77 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.97 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  32.86 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  35.82 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  39.39 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  37.84 
 
 
796 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  38.57 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  46.15 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  38.71 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  38.71 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  38.6 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  34.38 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  26.76 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  32.39 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.14 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  26.76 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  37.5 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  34.29 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.71 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  31.43 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.1 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  31.43 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  35.71 
 
 
75 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  32.86 
 
 
76 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.71 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  33.33 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  30.88 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  34.78 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  30.3 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  32.69 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  32.69 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  36.54 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>