235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2086 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  167  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  51.43 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.73 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  41.67 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  42.03 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  41.67 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  41.67 
 
 
79 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  41.67 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  38.67 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  41.1 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  35.06 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  39.44 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.49 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  33.78 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  33.78 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  40.28 
 
 
83 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  35.71 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  38.89 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  38.36 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  37.1 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  32.89 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  42.03 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  39.71 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  36.99 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  40.54 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  37.66 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  38.03 
 
 
74 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  40.32 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  38.24 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  36.76 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  38.24 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  34.25 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  35.71 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  30 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  35.14 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  35.14 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  34.78 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  39.71 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32.88 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.72 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  37.7 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  45.76 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.76 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  32.47 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38.36 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.71 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  39.71 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  36.49 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  31.08 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  34.52 
 
 
83 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  35.53 
 
 
83 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  38.03 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  31.51 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  31.51 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  38.71 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  35.21 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  32.86 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  38.71 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  38.71 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  38.71 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  32.47 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  30.56 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  31.94 
 
 
201 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.33 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  32.88 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  33.82 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  39.44 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  35.62 
 
 
80 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  32.35 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.43 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  32.35 
 
 
77 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  31.51 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  32.1 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  35.29 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  33.33 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  33.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.08 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  33.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  34.25 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  32.86 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>