64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1672 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  245  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  83.59 
 
 		 128 aa  218  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  42.31 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  38.46 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  39.06 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  33.59 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  39.69 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  35.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  48.1 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  48.1 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  48.1 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  31.37 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  30.4 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  33.87 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  32.28 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  32.28 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  38.54 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  30.39 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  32.28 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  33.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  30.4 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  31.5 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  31.5 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  41.38 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.25 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  35.23 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  25.98 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  25.98 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  31.65 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  28.91 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  38.2 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  32.89 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  32.2 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  28.8 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  26.55 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  23.53 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  30.4 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  27.42 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  29.51 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  30.08 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  28.8 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  30.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  29.73 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  28.8 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  35.96 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  34.52 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  31.01 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  31.01 
 
 		 127 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  29.31 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>