45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5906 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  97.78 
 
 
135 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  47.24 
 
 
132 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  34.88 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  37.6 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  35.64 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  40.82 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  33.59 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  31.13 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  30.84 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  34 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  31.82 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  32 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  35.29 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  28.28 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  30.25 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  30.25 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  26.23 
 
 
139 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  26.23 
 
 
139 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  26.96 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  37.66 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  31.07 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  31.07 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  26.52 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4095  hypothetical protein  39.76 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  26.96 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  35.53 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  24.04 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  34.21 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  36 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2943  hypothetical protein  30.84 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  25.22 
 
 
134 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0100  hypothetical protein  29.9 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  29.46 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  29.46 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  32.65 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  32.39 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  27.37 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>