43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2571 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  39.5 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  42.31 
 
 		 128 aa  84.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  41.54 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  36.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  40.21 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  34.65 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  32.54 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.88 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.88 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.88 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  29.03 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  38.14 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  28.89 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  32.59 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  32.63 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  30.08 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  31.96 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  31.11 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  30.21 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  27.82 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  25.55 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  33.05 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  31.33 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  32.58 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  28.79 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  26.14 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  32.88 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  28.79 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  28.79 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  25.98 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  27.48 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  36.71 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2943  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  36.78 
 
 		 124 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  28.03 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  28.03 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  28.23 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  29.07 
 
 		 127 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>