53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1222 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  251  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  59.69 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  44.19 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  42.62 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  47.93 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  44 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  38.4 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  44.66 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  40.31 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  40.21 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  35.4 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  34.62 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  34.62 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  30.53 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  41.98 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  31.25 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  38.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  32.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  36.76 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  39.24 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  32.32 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  34.65 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  32.93 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  28.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  30 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  28.85 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  33.01 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  33.72 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  34.04 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  29.37 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  36.76 
 
 		 127 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  30.65 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>