57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0523 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  255  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  39.5 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  35.11 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  34.35 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  38.61 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  35.16 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  35.53 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  30.58 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  33.66 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  33.66 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  33.77 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  33.67 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  34.94 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  29.69 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  29.06 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  32.56 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  31.78 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  30.23 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  31.78 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  29.69 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  31.78 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  30.85 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  31.39 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  31.01 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  31.01 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  32.04 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  27.59 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0100  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  29.2 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  26.02 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  26.02 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  26.02 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  25.2 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  30.26 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  26.02 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  29.92 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  30.26 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  31.63 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  29.13 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  31.76 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  29.41 
 
 		 126 aa  42  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  26.32 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  26.32 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  29.13 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  30.3 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>