21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2313 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  85.27 
 
 		 132 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  76.34 
 
 		 132 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.62 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.62 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.62 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  36.61 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  36.43 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  32.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  32.79 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  37.84 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  41.57 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0100  hypothetical protein  34.12 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  32.22 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  25.88 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  22.03 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  30.26 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>