66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2885 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  258  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  61.54 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  61.54 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  64.71 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  58.41 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  55.15 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  41.6 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  37.3 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  41.67 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  36.43 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  35.38 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  34.11 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  34.13 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  37.25 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  30.93 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  32.82 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  28.91 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  34.02 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  35.05 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  34.02 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  29 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  32.97 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  29.81 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  31.46 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  31.09 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  26.97 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  31.09 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  31.09 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  28.85 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  27.73 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  32.22 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  32.22 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  32.22 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  27.36 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  28.87 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  25.88 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0100  hypothetical protein  33.68 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  29.21 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  28.26 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>