63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2214 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  246  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  46.15 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  47.93 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  47.29 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  48.57 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  48.11 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  40.16 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  41.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  38.32 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  36.64 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  36.64 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  34.62 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  35.54 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  39.81 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  41 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  36.51 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  36.61 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  39 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  43.68 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  36.07 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  40.66 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  38.54 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  35.96 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  32.41 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  35.48 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  37.97 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  32.58 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  36.54 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  37.97 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  27.59 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  35.37 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  31.37 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  35.42 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  30.53 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  38.78 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  38.71 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.39 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.39 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  29.36 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  26.6 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.39 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  31.46 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  28.42 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  38.71 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  33.73 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  36.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  32.58 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  32.14 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  29.36 
 
 		 243 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  38.82 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  29.36 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  30.85 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  33.7 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  39.29 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>