49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0552 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  53.08 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  53.08 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  61.17 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  56.62 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  50.37 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  43.85 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  37.98 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  34.88 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  31.54 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  40 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  34.62 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  32.52 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  30.39 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  29 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  27.84 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  32.06 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  30.39 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  27.68 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  23.96 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  29.75 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  31.01 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  28.87 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  28.93 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  27.27 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  26.32 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  27.96 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  27.91 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  23.53 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  37.11 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  25.81 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  32.22 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  25.81 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  27.19 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  31.96 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  27.59 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  27.59 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  28.18 
 
 		 127 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  30.93 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>