41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04774 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  100 
 
 		 133 aa  258  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  59.69 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  47.54 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  46.83 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  47.29 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  35.2 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  37.86 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  40.54 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  37.21 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  38.14 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  42.73 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  36.15 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  36.15 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  41.57 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  37.72 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  40.91 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  31.62 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.51 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.51 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  39.51 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  33.64 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  31.62 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  31.63 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  34.34 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  32.54 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  32.28 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  29.35 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  34.38 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  37.36 
 
 		 127 aa  40  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>