37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2146 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  44.19 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  47.54 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  42.62 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  40.16 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  41.44 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  37.38 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  32.31 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  36.54 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  31.54 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  33.59 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  32.03 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  32.03 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  28.03 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  30.7 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  37.84 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  36.99 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  33.65 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  36.23 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  32.58 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  33.71 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  29.37 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  29.2 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  24.26 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  30.17 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  26.79 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  26.79 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  29.76 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  29.76 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  26.37 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  29.79 
 
 		 130 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>