14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2626 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  25.76 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  32.35 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  34.48 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  33.33 
 
 
136 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  33.64 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  27.68 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  28.1 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  28.1 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  23.53 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  24.26 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  27.05 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>