55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0963 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  100 
 
 		 131 aa  258  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  100 
 
 		 131 aa  258  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  61.07 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  57.35 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  55.15 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  52.78 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  40 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  32.82 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  36.11 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  36.64 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  36.15 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  35.92 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  32.03 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  33.86 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  36.08 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  33.07 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  34.68 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  34.15 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  34.15 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  32.28 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  34.15 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  33.64 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  39.24 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  31.82 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  34.34 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  31.62 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  28.1 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  33.96 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  29.01 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  32.26 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  36.99 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  29.01 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  29.91 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  29.23 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  30.26 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  28.24 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  26.88 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  27.91 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  34.15 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  29.67 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>