21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3991 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  85.27 
 
 		 132 aa  234  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  76.74 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.24 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.24 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  47.24 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  32.54 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  34.11 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  32.56 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  33.59 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  33.67 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  36.99 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  33.04 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  40.91 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  28.89 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  29.23 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  29.23 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  35.06 
 
 		 128 aa  42  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0100  hypothetical protein  32.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  27.05 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  27.66 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>