53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2145 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  100 
 
 		 133 aa  257  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  36.15 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  34.62 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  32.82 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  33.77 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  28.03 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5541  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.94 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6412  membrane-associated protein in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.94 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2626  hypothetical protein  25.76 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139688 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5906  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  34.94 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  32.77 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  35.09 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  31.82 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  31.62 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  31.82 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  30.47 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  31.43 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  32 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  32.04 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  29.81 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  25.78 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  31.4 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  28.36 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  30.85 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  30.85 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  29.01 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  29.01 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  32.22 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  28.26 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  29.55 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  28.24 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  28.97 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  31.11 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  29.75 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  30 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  29.75 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  28.93 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  28.89 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  28.21 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  28.09 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  25.81 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3991  hypothetical protein  27.66 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 130 aa  40  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  28.33 
 
 		 127 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>