69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2744 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  58.91 
 
 
131 aa  160  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  57.03 
 
 
135 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  57.03 
 
 
135 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  40.37 
 
 
134 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  37.82 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  37.96 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  37.96 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  38.53 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  36.63 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  37.29 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  37.21 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  34.91 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  42.11 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  33.96 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  35.11 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  29.91 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  33.62 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  29.91 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  29.91 
 
 
243 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  39.02 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  35.11 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  35.11 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  32.79 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  32.98 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  33.33 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1709  hypothetical protein  42.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  35 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  31.09 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  38.27 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  30.69 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  35 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  32.73 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  31.91 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  30.28 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  35 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  31.19 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  31.19 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  31.19 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  34.67 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  30.28 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  30.28 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  29.73 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  32.77 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  31.2 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  31.07 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  27.43 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  32.48 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  29.75 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  30.84 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2820  hypothetical protein  24.72 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216642  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  34.07 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2313  hypothetical protein  22.03 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0716954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  27.91 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  25.81 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  39.02 
 
 
143 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>